食指指甲蓋有小凹坑可能是甲營養不良、甲癬、甲溝炎等原因導致的，不同原因可采取不同的治療方式。
1.甲營養不良：甲營養不良是甲板形成過程中出現異常導致的一種疾病。患者可能會出現甲脫落、甲板裂開、指甲變白等情況。患者可以按照醫囑使用重組人表皮生長因子凝膠(酵母)、他克莫司軟膏、氟康唑膠囊等藥物進行治療。
2.甲癬：甲癬是皮膚癬菌侵犯甲板及甲下所引起的甲病變，患者通常會出現甲板渾濁、增厚、表面粗糙不平等癥狀。患者可以按照醫囑使用鹽酸阿莫羅芬搽劑、環吡酮胺乳膏、鹽酸特比萘芬片等藥物進行治療。
3.甲溝炎：甲溝炎是一種常見的甲周組織感染。患者的甲周組織通常會出現紅腫、熱痛等癥狀，患者的指甲還可能會變形，比如隆起、溝槽、褪色、缺損等。患者可以按照醫囑使用醋酸氯己定溶液、魚石脂軟膏、復方磺胺甲噁唑片等藥物進行治療。
這種情況還不排除是銀屑病甲引起的，患者需要到醫院明確病情后，再對癥治療。