鐵皮石斛通常有保質期，而且保質期的長短根據其形態和保存條件的不同而有所變化。
新鮮的鐵皮石斛保質期較短，大約一周。若需延長保鮮，可放在冰箱冷藏，建議溫度為3-5℃，此時一般可以保存約1周，但還是建議盡快食用以保證營養成分不流失。鐵皮石斛鮮條在適當保存條件下，如通風干燥、無陽光直射且無異味的地方，保質期約為2個月，開啟包裝后需要更加注意密封，以防發芽或變質。經過干燥處理的鐵皮石斛楓斗保質期較長，通常在正常保存條件可以保存1-2年。
保存鐵皮石斛的關鍵在于防潮、避光、通風，以及避免高溫和異味。如果存儲不當，鐵皮石斛可能會提前變質，表現為顏色、質地或氣味的變化。過期的鐵皮石斛是否能食用則需視情況而定。如果沒有出現明顯的受潮、發霉或變色、變味，理論上還可以食用，但藥效可能會降低。但是如果出現任何變質跡象，則不應食用，以免引起健康問題。