結核菌涂片檢查通常是指結核分枝桿菌涂片檢查，是將攜帶有結核分枝桿菌污染的分泌物、腹水等進行涂片鏡檢，以判斷患者是否存在結核分枝桿菌感染的實驗室檢查。
臨床進行結核分枝桿菌涂片檢查時，會將含有結核分枝桿菌的腦脊液、腹水、痰液、尿液等，經過離心濃縮或直接涂抹于載玻片上，通過油鏡觀察。因結核分枝桿菌屬于抗酸桿菌，故通過抗酸染色后，結核分枝桿菌一般會呈紅色，如果涂片上可見紅色桿狀細菌，多說明存在結核分枝桿菌感染。
但是因為玻片有可能被其他抗酸桿菌污染，結核分枝桿菌涂片檢查為陽性后，需要再次進行分離培養。此外，因結核分枝桿菌檢出率較低，即使結核分枝桿菌陰性，也不能認為不存在結核分枝桿菌感染，故需要進行至少3次檢查，以進行鑒別診斷。
結核分枝桿菌涂片檢查只是作為一種輔助診斷方法，臨床還可通過患者病史、臨床癥狀、PPD試驗、γ-干擾素釋放試驗、胸部CT等，以幫助判斷是否存在結核分枝桿菌感染。