正常情況下，一般人群適量吃巴沙魚，沒有明顯害處，反而對健康有益。但如果長期過量吃，可能會造成營養過剩、消化不良等。
巴沙魚含有豐富的蛋白質、鈣、磷、碘、鋅等營養元素，肉質軟嫩，易消化，適合大部分人群吃，適量吃可為人體補充能量和多種營養素，對健康發育有利，一般沒有害處。魚類與其他肉質相比，營養結構均衡，且熱量和脂肪含量低，肉質疏松且易消化吸收，較適合腸胃功能差的人群。從營養學角度講，建議每周吃魚280-525克，不宜過量吃。
如果攝入過多巴沙魚，人體內的蛋白質會超標，導致部分蛋白質不能被吸收和利用，堆積在身體內造成營養過剩，還可能會引發消化不良，出現腹瀉、腹脹、腹痛等，還會增加肥胖的概率。巴沙魚吃多了，如果影響其他營養物質攝入，長期如此會使飲食結構不均衡，營養有所缺乏，不利于身體健康。另外，對海鮮過敏的人群，吃巴沙魚可能出現皮膚瘙癢、皮疹、蕁麻疹、哮喘等，應避免吃。