一般來說，孕29周做完小排畸后流血后腰疼可能是婦科炎癥、先兆流產等原因導致的，具體分析如下：
1.婦科炎癥：孕婦流血后腰疼一般與做小排畸檢查無關，如果孕婦患有婦科炎癥，由于體內激素水平的不穩定、個人衛生不到位等，可能導致炎癥加重，出現流血后腰疼的癥狀。患者可以在醫生指導下進行生活習慣調理，飲食清淡，注重衛生。
2.先兆流產：孕29周由于各種原因也可能出現先兆流產的癥狀，如果流血、腰疼癥狀逐漸加重，孕婦要及時在醫生指導下使用黃體酮膠囊、保胎靈膠囊、地屈孕酮片等藥物進行保胎治療。