無論乳腺囊腫是6×3mm，還是更大的尺寸，只要確定是乳腺囊腫，此種情況就并不嚴重，無癥狀者通常不需要特別處理。乳腺囊腫通常不會產生癌變，所以即使比較大，通常也不需要特殊處理。但如果乳腺囊腫伴有其他癥狀，或有惡變可能，則可能較為嚴重。
如果乳腺囊腫6×3mm的患者繼發感染，出現疼痛的情況，則較單純乳腺囊腫而言更為嚴重，通常可以遵醫囑使用抗生素進行治療，比如青霉素等。藥物治療效果欠佳或已經形成膿腫時，需要手術切開引流。
此外，乳腺的囊性癌變可能也會表現為乳腺囊性腫塊，但這種腫塊生長比較迅速，臨床建議患者進行乳腺囊腫的穿刺活檢，如果穿刺結果是惡性的病灶，需要做進一步的處理，比如手術治療等。如果穿刺結果是良性病灶，建議患者定期復診觀察。一般是每半年做一次乳房彩超檢查，判斷乳腺囊腫是否有變嚴重的情況。
總而言之，單純性的乳腺囊腫不嚴重，不管大小是6×3mm或者是更大的直徑，建議患者進行定期的觀察，而不需要做特別的處理。除非出現并發感染，或囊性惡變的可能，才需要進一步到醫院做相關的檢查，以及進一步治療。
乳腺囊腫患者日常需要保持健康的生活方式，需要配戴合適的胸罩，減輕胸部壓力，避免壓迫乳房。保持乳房局部的清潔，避免外傷，哺乳期注意避免乳汁淤積。