結核菌涂片檢查又稱為結核分枝桿菌涂片檢查，主要目的是查找結核抗酸桿菌，是臨床上簡單、快速、易行的方法之一。結核分枝桿菌涂片檢查時，若未找到抗酸桿菌，說明本次痰中沒有結核桿菌存在，表示暫無活動性結核感染的證據，或活動性結核感染經過治療后痰菌轉陰，病情好轉，患者通常無傳染性或傳染性較低。
1、沒有感染結核或為菌陰性結核病：非肺結核患者進行結核分枝桿菌涂片檢查，正常為陰性，即未找到抗酸桿菌，沒有傳染性。但臨床上確實存在檢查陰性，但有活動性肺結核的患者，此類患者有肺結核的癥狀，還需結合肺部CT等其它相關檢查明確，若確診為肺結核，需進行抗結核治療。但一般檢查為陰性的肺結核患者傳染性相對偏低；
2、經治療好轉：結核分枝桿菌涂片檢查為陽性的肺結核患者，經過強化期積極抗結核治療后，復查時未找到抗酸桿菌，通常提示治療效果較好，體內的結核桿菌已經得到控制。
但通過結核分枝桿菌涂片檢查查找抗酸桿菌，有時也受標本是否合格等因素的影響，所以患者通常要送3份痰標本，包括晨起痰、夜間痰和隨機痰，無痰者可通過霧化等方式，誘導獲取痰標本。對于痰菌陰性者，要在醫生指導下，依據病情具體分析判斷是何種情況，難以辨別時可進行進一步排查。