抗酸桿菌中常見的細菌是分枝桿菌，而分枝桿菌也包括很多種，如結核分枝桿菌、麻風分枝桿菌等，其中結核分枝桿菌是引起肺結核，以及其它結核的常見病原菌。抗酸桿菌陰性會不會傳染，需要具體情況進行分析。
1、會傳染的情況：如果在進行肺結核篩查時，只進行一次痰液抗酸桿菌涂片檢測呈陰性，可能具有傳染性。肺結核是一種由結核分枝桿菌感染，引起的呼吸系統傳染病，病灶主要發生于肺組織、氣管、支氣管和胸膜部位，肺結核的常見癥狀有低熱、乏力、消瘦、咳嗽、咯血等。肺結核主要傳染源，為痰中帶菌的肺結核患者和活動性的肺結核患者，通常有較強的傳染性。結核分枝桿菌的主要傳播途徑是經空氣傳播，當肺結核患者咳嗽、打噴嚏、大笑時，可能將含有結核分枝桿菌的飛沫播散到空氣中，并且飛沫可在空氣中停留數小時，若被他人吸入呼吸道就可能會導致感染；
2、不會傳染的情況：如果在三次不同時間段，進行痰液抗酸桿菌涂片檢測呈陰性，那么可能不具有傳染性。因為痰液抗酸桿菌涂片陽性率比較低，易造成假陰性的結果出現，所以通常需要進行多次檢測，并結合影像學的檢查，以及其他結核菌進行反復驗證后，才能確定機體是否存在結核分枝桿菌，以及是否會傳染。
當肺結核患者確診后，必須及時進行抗結核治療，通常在應用標準的抗結核治療方案兩個月后，患者的傳染性就會逐漸降低，但也不排除個別患者治療進程緩慢，治療時間會有所延長。