張仲景治療結腸炎的經方較多，常見的有半夏瀉心湯、白頭翁湯、小建中湯等，需要在醫生的指導下進行使用。
1、半夏瀉心湯：主要由半夏、黃芩、干姜、甘草、人參、大棗、黃連所組成，可以用于結腸炎的治療，其中半夏可以祛胃內之停水，而止嘔吐。黃連、黃芩能消退胃腸之炎癥，人參、干姜能興奮胃腸之血行，促進胃腸機能恢復。甘草、大棗以調和諸藥，強化其協同作用。
2、白頭翁湯：組成藥物有白頭翁、黃柏、黃連、秦皮，具有清熱解毒、涼血止痢的功效，結腸炎患者使用可以緩解腹痛、里急后重等癥狀。
3、小建中湯：藥物由桂枝(去皮)、甘草(炙)、大棗(擘)、芍藥、生姜(切)、膠飴所組成，結腸炎患者使用具有溫中補虛、和里緩急的功效，可以緩解脘腹拘急疼痛，時發時止，喜溫喜按。
此外，還有連理湯、芍藥湯、葛根芩連湯、四物湯、黃連阿膠湯等，也可以遵醫囑進行使用。建議結腸炎患者到醫院的中醫科就診，完善望、聞、問、切等檢查，由醫生進行辨證論治。
