吹空調肩胛骨后背疼可能是著涼引起，也可能與肩背肌筋膜炎、肩周炎、頸椎病等因素有關，需要在醫生幫助下明確病因，然后對因治療。
1、著涼：吹空調時如果溫度過低、風速較大等，導致肩胛骨以及后背部位著涼，引起血液循環減慢，容易引起背部肌肉痙攣，出現疼痛等癥狀。無需特殊治療，平時可注意背部保暖，多加休息，同時適當進行熱敷，一般可自行緩解。
2、肩背肌筋膜炎：指由于外感風寒、勞損或外傷等引起的肩背部肌筋膜的無菌性炎癥，常表現為肩背部酸痛不適，肌肉僵硬感，有時向一側或兩側背部與肩胛骨之間放射，甚至牽涉引起前胸部疼痛不適。患者可遵醫囑應用塞來昔布膠囊、布洛芬緩釋膠囊等藥物緩解疼痛，也可采取物理治療，如紅外線、微波治療等。
3、肩周炎：是由于肩關節周圍軟組織病變而引起肩關節疼痛和活動功能障礙，主要表現為肩關節周圍疼痛，肩關節各個方向主動和被動活動度相應下降。肩周炎患者如果吹了較長時間的空調，可能會導致疾病復發，出現肩關節周圍疼痛，甚至可放射至背部，患者可進行熱敷，病變早期，上肢應懸吊制動，每天輕度活動肩關節數次，并遵醫囑應用阿司匹林腸溶片等藥物緩解。
4、頸椎病：頸椎退行性病變是導致頸椎病的主要原因，椎管狹窄、慢性勞損次之，也可因誘發因素導致頸椎病的發生，如突然的撞擊、頸部受涼等，可引起頸背疼痛、僵硬、四肢麻木無力、頭暈、惡心、嘔吐等癥狀，患者可以通過改善生活方式，積極進行鍛煉，如慢跑、騎自行車等，端正體態姿勢，改善癥狀，減輕痛苦。
除以上因素外，還可能是冠心病等導致，建議疼痛比較嚴重的患者及時前往醫院就診，由醫生根據具體疼痛情況，以及相關檢查結果，如血常規、CT檢查等進行判斷。