通常情況下，寶寶吃藻油比較好，主要是由于藻油中并不含二十碳五烯酸(EPA)，二十二碳六烯酸(DHA)純度更高一些，所以安全度更高，可以在醫生建議下適當使用。
DHA魚油多以深海魚為原材料，通過分子蒸餾工藝制得，除富含DHA外，魚油中還含有EPA。EPA可以促進身體發育，寶寶如果在日常生活中攝入過多EPA，有可能會導致性早熟的情況發生，所以更推薦寶寶使用藻油。
而藻油是以富含DHA，而不含EPA的海洋微藻為原料，通過發酵工藝制得，只有DHA，所以其中的DHA純度較高，相對而言，藻油的安全度更高。DHA是一種富含ω-3多不飽和脂肪酸的油脂，在進入人體后，可促進大腦以及視網膜發育。
需要注意，DHA魚油、藻油均屬于保健品，并不具有治療疾病的功效，需要避免盲目食用。部分寶寶在服用藻油后可能會出現不適癥狀，如腹瀉、腹痛等，此時建議停止服用，及時尋求醫生幫助。