核酸檢測是很多種病毒感染的檢測方法，可以通過鼻咽拭子或者口咽拭子進行。其兩者區別主要在于采樣部位、操作方法不一樣，以及舒適度也有所區別。
1、采樣部位：口咽拭子主要將棉拭子探入被檢者口腔，隨后進入口咽部進行采樣，而鼻咽拭子的采樣部位多需要通過鼻腔，在鼻咽部進行；
2、操作方法：因為采樣部位不一樣，所以操作也不一樣。口咽拭子檢測，首先囑被檢者頭稍抬高，張口暴露咽扁桃體、咽后壁。讓患者發聲，然后用拭子在咽扁桃體處擦拭3次，隨后在咽后壁上下擦拭3次，最后將拭子棒折斷放入保存液中。而鼻咽拭子檢測，首先囑被檢者稍抬頭，將拭子貼近鼻孔插入到達鼻道底部，然后向后進入，拭子到達鼻咽后壁輕輕旋轉一周，最后取出拭子，將拭子棒放入保存液中；
3、舒適度不一樣：對于兩種核酸拭子檢測，從對被檢者的舒適度和接受程度的區別。口咽拭子有的會引起咳嗽，咽部異物感，但總體刺激性小，鼻咽拭子刺激到鼻腔粘膜刺激性會更大。總體來說，口咽拭子更容易被人接受，一般情況下小孩、老人也能夠完成。
