核酸檢測鼻拭子和咽拭子不完全一樣，但區別也較小，都是用于核酸檢測的方法，受檢者可以根據自己的情況在工作人員的指導下選擇鼻拭子或者咽拭子。
核酸檢測是指核酸定性、定量、測序或通過雜交檢測同源性的技術方法，通過查找患者的呼吸道標本、血液或糞便中是否存在外來入侵病毒的DNA和RNA，來判斷是否被病毒感染的方法，檢測方法包括鼻拭子、咽拭子等。鼻拭子通常是用棉棒采集鼻腔內側、鼻黏膜處分泌物來進行檢測，而咽拭子是需要采集咽喉后壁處標本檢測。由于采集鼻拭子樣本時，棉簽需要進入鼻腔內部，可能會對鼻腔黏膜造成一定刺激，會有出血、疼痛等不適癥狀，因此患有鼻腔疾病者，如過敏性鼻炎、鼻竇炎等，建議選擇咽拭子檢測。反之，如果患有咽喉疾病者，建議選擇鼻拭子檢測，避免因檢測對咽喉或鼻腔造成損傷。
核酸檢測的鼻拭子和咽拭子的準確率幾乎相似，建議進行核酸檢測時做好個人防護，避免過多和他人進行密切交談，不要到人群聚集的場所，如果出現核酸陽性的情況，需要及時進行治療。