甲流一般指甲型流行性感冒。甲型流行性感冒頭疼、睡不著可能是發熱、長期熬夜、合并腦炎等因素導致的，建議及時前往正規醫院就醫，并對癥治療。
1.發熱：當患者患有甲型流行性感冒后，會出現發熱的癥狀，可能會導致腦血管擴張，從而引起頭疼、睡不著。患者可遵醫囑使用布洛芬緩釋膠囊、對乙酰氨基酚片等藥物進行治療，可以起到退熱的作用。
2.長期熬夜：如果患者在患病期間長期熬夜，容易導致大腦疲勞，從而引起頭疼，部分患者還可能會出現睡不著的情況。建議患者在患病期間避免過度勞累，還可以按摩頭部，以緩解頭疼的癥狀。
3.合并腦炎：腦炎主要由病原體感染腦實質引起，可出現發熱、抽搐、意識障礙等不適癥狀。如果患者患有甲型流行性感冒后合并腦炎，導致病情進一步加重，可能會出現嚴重的頭疼、失眠等不適。建議患者可以在醫生指導下使用阿昔洛韋注射液、注射用頭孢曲松鈉、頭孢克肟顆粒等藥物來治療，可以抑制病原微生物。
除上述相對常見的原因外，患者的情況還可能與合并腦血管痙攣、合并腦膜炎、合并高血壓等有關，建議患者及時前往醫院就診。治療期間要合理飲食，不要挑食。