男性包莖皮有水皰，通常需要針對具體的病因進行治療，這通常是由包皮炎、外傷、生殖器皰疹、尖銳濕疣、軟下疳等疾病引起的，可以及時就醫，通過涂抹藥物等方法進行治療。
1、包皮炎：如果男性在日常生活中不注重局部清潔，可能會有大量細菌侵入，這不僅會引發包皮炎，還可能刺激黏膜，導致水皰生成。為了治療這種情況，可以考慮遵醫囑使用莫匹羅星軟膏等藥物。
2、外傷：如果日常穿著的衣服太緊或過于堅硬，可能會因摩擦陰莖而產生水皰，而不小心被熱水燙傷也有可能導致局部出現水皰。當水皰發生破裂時，應迅速使用碘伏、酒精等外部消毒劑進行涂抹，以防止感染的發生。即使水皰體積較大，也可以使用無菌注射器來吸取組織液，這對于組織的恢復是有益的。
3、生殖器皰疹：正常情況下，生殖器皰疹是由日常不衛生的性行為引起的，顯著的癥狀是在包莖皮上形成小水皰。在嚴重的情況下，皰疹還可能導致糜爛和出血。為了治療，可以考慮使用阿昔洛韋軟膏等藥物。
4、尖銳濕疣：這是一種由人乳頭瘤病毒導致的性傳播疾病，通常會在陰莖皮膚上形成小水皰或粒狀的疣狀病變。可以按照醫生的建議進行藥物治療，常見的藥物包括咪喹莫特乳膏和斑蝥素乳膏等。
5、軟下疳：這是一種由杜克雷嗜血桿菌引發的性傳播疾病，會在陰莖皮膚上形成小水皰，并伴有其他癥狀，例如瘙癢和潰瘍。在醫生的建議和指導下，可以接受各種物理療法，如冷凍療法和激光療法等。
如果出現相關的疾病癥狀，建議盡快尋求醫療幫助，并與醫生緊密溝通進行治療，注意上述藥物的使用應在醫生的指導下，不宜盲目用藥。在較短的時間里，男性應避免性行為，并確保經常更換和清洗內褲。