吳茱萸與山茱萸雖名稱相似，但在來源、性味歸經、藥效及臨床應用上各有不同。在治療疾病時，務必依據醫生的建議，避免自行選用導致誤用風險和可能的不良反應。
1.來源：吳茱萸源于兩種植物，即吳茱萸果實（干燥成熟）和疏毛吳茱萸果實，而山茱萸則來自山茱萸的成熟果肉；
2.性味歸經：吳茱萸味道辛、苦，主要影響肝、脾，其特性為辛熱；山茱萸則是味道酸澀，性微溫，僅對肝經有影響；
3.藥效：吳茱萸有降逆止嘔、溫陽止瀉及解寒止痛的功效，山茱萸則以補肝腎、固澀見長；
4.臨床應用：在臨床應用中，吳茱萸適用于胃寒嘔吐、寒痛和虛寒腹瀉等病癥，山茱萸則用于肝腎虧虛的治療。山茱萸主要應用于遺精、滑精、尿頻及月經過多等癥狀，針對腰膝無力、頭暈耳鳴和陽痿問題。
患者可在醫生建議下，適量使用吳茱萸與山茱萸，避免自行選擇。