吳茱萸的副作用和禁忌包括胃腸道反應、過敏反應、孕婦慎用、陰虛火旺者忌用、實熱證者禁用等，建議及時就醫并遵醫囑治療。
1.胃腸道反應：吳茱萸味辛、苦，性熱，有小毒。服用后可能引起胃腸道不適，如惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉等癥狀。這是因為其辛辣燥熱之性對胃腸道黏膜產生刺激，尤其是過量服用時，這種刺激更為明顯，可能影響胃腸道的正常消化和吸收功能，導致脾胃功能紊亂。
2.過敏反應：部分人群對吳茱萸過敏，接觸或服用后可能出現皮膚瘙癢、紅斑、皮疹等過敏癥狀，嚴重者可出現呼吸道過敏，如呼吸困難、喉頭水腫等。這是機體對吳茱萸中的某些化學成分產生的異常免疫反應，一旦出現過敏癥狀應立即停止使用，并進行相應的抗過敏治療。
3.孕婦慎用：吳茱萸的藥性溫熱且有小毒，孕婦處于特殊生理時期，其藥性可能影響胎兒的正常發育，增加流產或胎兒畸形的風險。所以在孕期應避免使用吳茱萸，除非在醫生的嚴格評估和指導下，認為利大于弊時才可謹慎應用。
4.陰虛火旺者忌用：吳茱萸性熱，對于陰虛火旺之人，如表現為口干咽燥、五心煩熱、潮熱盜汗、舌紅少苔、脈細數等，服用吳茱萸會進一步加重體內的虛火，導致陰虛癥狀加劇，使陰陽失衡更加嚴重，不利于身體健康的恢復，甚至可能引發其他并發癥。
5.實熱證者禁用：體內有實熱之邪，如高熱、面紅目赤、大便干結、小便短赤、舌紅苔黃等癥狀者，吳茱萸的溫熱之性會助長實熱，使病情惡化，如同火上澆油，所以實熱證患者嚴禁使用吳茱萸。
使用吳茱萸時應嚴格遵循醫囑，控制劑量，密切觀察身體反應。