乳糖不耐受和牛奶蛋白過敏之間有明顯的區別，乳糖不耐受是非免疫反應，主要表現為消化道癥狀。而牛奶蛋白過敏屬于免疫反應，除了會出現消化道癥狀外，通常還會伴隨皮膚癥狀和呼吸道癥狀。
1、乳糖不耐受：乳糖不耐受是由于體內缺少乳糖酶，或者由于腸黏膜損傷，使小腸上皮乳糖酶活性暫時降低，不能分解牛奶或母乳中的乳糖所致，屬于非免疫反應。乳糖不耐受通常會出現消化道癥狀，如嘔吐、腹痛、腹瀉、腸絞痛等，且會排出黃綠色的泡沫狀大便，伴有酸臭味；
2、牛奶蛋白過敏：牛奶蛋白過敏屬于免疫反應，是由于牛奶蛋白作為過敏原刺激機體所致。而牛奶蛋白過敏除了會表現為惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、排氣增多、大便帶血絲等消化道癥狀外，還會出現皮疹、濕疹、蕁麻疹等皮膚癥狀，還有可能會引起咳嗽、喘息等呼吸道癥狀。
若喝了牛奶出現消化道癥狀，建議前往專科醫院做過敏原檢測了解原因，若是乳糖不耐受引起的，可以在服用牛奶之前服用乳糖酶，結合益生菌調理，或者服用無乳糖配方奶粉喂養，能逐漸改善癥狀。若是牛奶蛋白過敏引起的，則需要更換奶粉，可以喝氨基酸奶粉或深度水解奶粉，必要時需要遵醫囑使用抗組胺類藥物進行治療，比如鹽酸左西替利嗪片、氯雷他定片等，能有效緩解過敏癥狀。