感冒好了頭疼可能與藥物不良反應、偏頭痛、病毒性腦炎等因素有關，需要根據實際情況進行相應的處理。具體分析如下：
1.藥物不良反應：若患者感冒期間用藥不當，可能會引起藥物不良反應，進而導致感冒好了頭疼的癥狀。患者可以適量飲水，促進藥物的代謝，從而減輕不適癥狀。
2.偏頭痛：感冒可能會影響腦部供血，從而誘發偏頭痛，進而可能會出現感冒好了頭疼的癥狀。患者可以在醫生指導下應用塞來昔布膠囊、布洛芬緩釋膠囊等藥物進行治療。治療期間，患者應該注意休養，避免過度勞累。
3.病毒性腦炎：感冒可能會引起病毒性腦炎，進而可能會引起感冒好了頭疼的癥狀，患者還可能伴有惡心、肌痛等癥狀，可以在醫生指導下應用更昔洛韋片、阿昔洛韋片等藥物進行治療。治療期間，患者應該注意調節情緒，少吃辛辣刺激性食物。