戊二醛一般可以用在住人屋消毒，如醫院病房，對人體是否有害通常需要根據使用方法判斷。生活中要盡量避免接觸對身體有害的物質，如殺蟲劑、除草劑，以免影響健康。
戊二醛屬于比較常用的廣譜、高效消毒劑，能夠殺滅微生物，可用于醫療器械滅菌，也可以用在住人屋的消毒。如果在使用時做好防護措施，如戴上手套、口罩等，沒有直接接觸皮膚黏膜，而且使用的劑量比較小，也比較注意開窗通風透氣，通常對人體不會有害。戊二醛的刺激性相對比較大，可能會對皮膚黏膜、眼睛產生刺激，如果在使用時沒有做好防護措施，未佩戴口罩、手套，皮膚接觸了戊二醛可能會灼傷皮膚。如果使用的濃度比較大，不注意通風，吸入過多戊二醛氣味，可能會對呼吸道黏膜產生刺激，可能會引起支氣管炎、化學性肺炎，也可能會引發肺水腫。
在進行房間消毒時可以選擇危害性比較小的消毒水，還要開窗通風透氣，保持室內空氣流通，避免人體吸入過多消毒水的味道，而引起呼吸道不適。