紅茶菌是由糖、茶、水加菌種經發酵制成，長期喝紅茶菌的人會怎么樣不能一概而論，通常長期適量飲用對人體能夠產生一定的好處。但若是長期大量飲用紅茶菌，可能會對人體造成不好的影響。
長期適量飲用紅茶菌，其中含有的醋酸、乳酸可以促進胃酸分泌，有助于消化和排便。紅茶菌含有的咖啡因還可以提高大腦活力，有助于消除疲憊感。
但若是長期大量飲用紅茶菌，其中含有的醋酸、乳酸在幫助消化的同時會增強食欲，就會引起饑餓感，可能會導致進食量或者次數增加，長期如此就會引起發胖。大量飲用紅茶菌還可能導致大量胃酸分泌，會引起反酸、惡心等不適癥狀，有可能誘發或者加重胃病。而紅茶菌含有的咖啡因大量累積，會導致中樞神經過度興奮，造成失眠、心悸等癥狀。紅茶菌含有的有機酸還可能會導致過敏反應，出現皮膚發癢、腹瀉等癥狀。