多數情況下，長期適當喝紅棗菊花茶對身體較好，有助于補充氣血、清肝火，但若持續過量飲用，這種前提下會引起身體異常現象，對身體一般不好。
紅棗具有補中益氣、養血安神之效。長期飲用紅棗菊花茶，紅棗能為人體持續補充氣血，對于氣血不足者，可改善面色萎黃、神疲乏力等癥狀，增強體質。
菊花性微寒，有散風清熱、平肝明目之功。在紅棗菊花茶中，菊花能清肝火，緩解眼睛干澀、腫痛等問題。長期面對電子設備或用眼過度者，適量飲用可保護視力，減輕眼部疲勞。
從二者搭配角度，紅棗的溫性與菊花的寒性相互中和。使得茶飲性質趨于平和，對于一些體質相對平衡的人來說，長期飲用可在滋補氣血、清肝明目的同時，減少因單一食材偏性帶來的不良影響。
菊花的寒性即便有紅棗調和，長期過量飲用可能加重體內寒邪，可出現胃脘冷痛、腹瀉等癥狀，影響脾胃功能，導致消化吸收不良，使身體更加虛弱。此外，紅棗含糖量較高，長期大量飲用紅棗菊花茶，可能會導致血糖升高。尤其是對于糖尿病患者或血糖偏高者，這種茶飲可能會影響血糖控制，增加糖尿病并發癥的發生風險。
飲用紅棗菊花茶時，若出現身體不適，如胃痛、血糖異常等，應停止飲用，注意飲食衛生，并避免暴飲暴食。