通常不存在肉蓯蓉怎么吃效果最佳的說法，可以通過泡酒、煮茶、煎服、煮粥等方式進行服用。
肉蓯蓉是一味具有補陽功效的中藥材，入藥部位主要是肉蓯蓉的干燥帶鱗葉的肉質莖。肉蓯蓉藥性甘、咸、溫，歸腎、大腸經，主要含有松果菊苷、毛蕊花糖苷、松脂醇、表馬錢子酸、生物堿、糖類、微量元素、糖醇、固醇等物質，具有潤腸通便、益精血、補腎陽等作用，可以用于治療陽痿不孕、腰膝酸軟、便秘、精血虧虛、腎陽不足等癥狀。患者可以在醫生的指導下直接將肉蓯蓉煎汁內服；與鹿角膠、羊肉、粳米等食材一起煮粥；與枸杞、菟絲子一起泡酒；或者與玫瑰花、胎菊等茶葉一起煮成茶水，服用后對人體都有一定的好處。但長期服用肉蓯蓉可能會出現上火、影響肝腎功能等現象，因此不建議大量食用。
此外，由于肉蓯蓉是一味溫補性的藥物，通常陰虛火旺、大便泄瀉等人群不適宜服用，可能會使病情加重。也不宜與鎖陽一起服用，可能會導致溫補過度，引起上火。同時在日常生活中也要注意營養均衡，可以適當吃雞肉、魚肉、冬瓜、油麥菜、蘋果、香蕉等富含蛋白質和維生素的食物。也可以適當進行有氧運動，增強體質，提高人體免疫力。