通常情況下，腸道感染后反應性關節炎是腸道病原體感染、遺傳因素、不潔飲食、免疫力低下等引起的。
1、腸道病原體感染：腸道病毒感染病原體包括福氏志賀菌、耶爾森菌、痢疾、志賀菌、腸炎發生沙門菌、耶爾森假結核桿菌、空腸彎曲菌等。
2、遺傳因素：腸道感染后的反應性關節炎常與HLA-B27陽性相關，而親屬中有強直性脊柱炎的患者，的發病率明顯增高。
3、不潔飲食：不潔飲食后容易發生腸道感染，從而引起腸道感染后反應性關節炎的概率增大。
4、免疫力低下：人體免疫力下降，容易出現細菌感染，可能誘發腸道感染后反應性關節炎。