預防兒童結核病最好的方法是增強身體抵抗力，防止傳染病發生。
針對兒童肺結核，尤其是小兒粟粒結核及結核性腦膜炎，應采取適當措施，強化運動，強化身體素質，給予嬰兒接種BCG疫苗，以提高機體對結核菌的抵抗力。如果發生了感染，可以用抗結核藥治療肺結核患者，預防肺結核不適癥狀的發生。
在日常也要做好防護措施，避免感染結核桿菌。