腸胃炎主要是由感染性和非感染性引起的，細菌感染、病毒、真菌、寄生蟲等是引起腸胃炎的主要因素。非感染的原因主要有：膽汁或胰液反流、非甾體消炎藥物、食物過敏、自身免疫系統失調等。
另外，由于慢性、非特異性的腸炎，如潰瘍性結腸炎、克羅恩病等。出現急性腸胃炎的時候要注意鑒別病因，排除病因，對癥治療，平時要注意清淡、易消化、富含維生素的食物，不要吃辛辣刺激性的食物。