一般主張先手術切除腫瘤目的為明確腫瘤性質減小腫瘤體積為放療創造條件生殖細胞瘤是顱內腫瘤中對放療最敏感的腫瘤對高度懷疑生殖細胞瘤但不具備手術切除條件的患兒可在做腦室腹腔分流術后行放射治療傳統的放療方案是全神經軸放射治療包括：腫瘤灶50～55Gy全腦和脊髓30～36Gy以防止播散轉移此方案效果良好能將患兒10年期生存率提高到85%～100%目前研究多是用聯合化療來減少放療的范圍和劑量以防止放療造成的兒童生長發育停滯的副反應現已取得普遍認同的方法是：首先根據腫瘤CTMRI影像學特點結合血液腦脊液中腫瘤標記物(AFPβ-HCG)含量測定及腦脊液中腫瘤細胞學檢查結果對腫瘤性質做初步判定必要時可做立體定向活檢常用的化療藥物(如卡鉑長春新堿環磷酰胺等)可用作試驗性化療在化療過程中對影像學及腫瘤標記物復查以評價腫瘤對化療的敏感性如果化療反應敏感則在化療療程結束后做減量放療有人只減少放療劑量(瘤灶30Gy;脊髓軸21Gy)而不減少照射范圍近來有人在化療后對腫瘤做局部小范圍低劑量(24Gy)的放射治療也取得良好效果而對于松果體區生殖細胞瘤以外的生殖細胞腫瘤除成熟畸胎瘤預后較好外(手術切除后10年期PFS為92.9%)其他類型均表現顯著侵蝕性雖然對放化療也有一定效果但3年期整體生存率僅為27.3%