一般來說，初期應注重清潔消毒和避免摩擦，對于較大水皰可謹慎進行穿刺引流，同時配合涂抹藥膏和冷敷來緩解癥狀。建議及時就醫診治，謹遵醫囑。
1、清潔消毒：當小腳趾磨出水皰后，首先要用溫和的肥皂水清洗腳部，尤其是小腳趾周圍，將灰塵、細菌等清洗干凈，然后用碘伏輕輕擦拭水皰及其周圍皮膚進行消毒，防止感染。消毒時動作要輕柔，避免弄破水皰。
2、避免摩擦：盡量避免穿著擠腳或過硬的鞋子，選擇寬松、柔軟、舒適的拖鞋或涼鞋，減少對水皰部位的摩擦和壓迫，讓水皰有機會自然愈合。如果需要外出走動，也可以在水皰處貼上創可貼或醫用膠帶，起到一定的保護作用。
3、穿刺引流：如果水皰較大，疼痛明顯，且在消毒條件良好的情況下，可以用經過酒精消毒的細針，從水皰邊緣輕輕刺破，使里面的液體緩慢流出。但要注意，不要將水皰的表皮撕掉，可以起到保護創面的作用，之后再用碘伏消毒，并保持局部清潔干燥。
4、涂抹藥膏：在水皰處涂抹一些具有消炎、止痛、促進愈合作用的藥膏，如紅霉素軟膏、莫匹羅星軟膏等，可以預防感染，加速傷口愈合。涂抹時要注意方法，避免污染藥膏。
5、冷敷：用冰袋或冷毛巾敷在小腳趾水皰處，每次冷敷15-20分鐘，每天數次，冷敷能夠減輕疼痛和腫脹，緩解局部不適。
小腳趾磨出水皰是比較常見的情況，正確的處理方法有助于水皰的愈合和預防感染等并發癥，應及時就醫，以確保傷口能夠順利愈合，避免引發更嚴重的問題。