次氯酸消毒液是不可以喝的，只能外用，且用藥應謹遵醫囑。
次氯酸消毒液具有刺鼻的氣味，還有極強的漂白作用，只能外用，一般不能口服。若患者不慎吸入次氯酸消毒液，可能會腐蝕、灼傷口腔黏膜以及消化道黏膜，容易引起惡心、嘔吐、腹痛、反酸等癥狀。
次氯酸消毒液屬于強氧化劑，具有強氧化性，誤食后在酸性環境下可加強其腐蝕性，可能會導致胃炎、胃潰瘍等疾病的發生，甚至可能會引起胃出血、胃穿孔等情況。若患者出現上述情況應及時就醫。
次氯酸消毒液通常用于醫療衛生、公共場所衛生，以及食品、藥品的消毒處理，患者在使用本品的時候，應戴好口罩、手套，嚴格按照說明書來使用本品。如果長期使用或高濃度使用，且沒有做好防護措施，還可能會造成手部皮膚損傷，還可能會出現眼部損傷以及其他傷害等情況。
患者在平時還可以在醫生的指導下優先選擇醇類消毒劑、含碘消毒劑以及含氯消毒劑等消毒用品。這些消毒劑相較于次氯酸消毒液而言，對皮膚的刺激性相對較小，還也能起到很好的消毒效果。