對于大部分人群而言，次氯酸消毒液可以接觸皮膚，少部分過敏體質者不可以用此物品接觸皮膚。
次氯酸消毒液是一種弱酸性、強氧化劑，適用于醫療衛生機構、公共衛生場所和家庭的一般物體表面、醫療器械、醫療廢物等。對于大多數人群而言，次氯酸消毒液對于皮膚的刺激性相對不大，并且次氯酸消毒液在殺滅微生物中起著重要作用，患者需要對皮膚進行消毒時，可以少量使用次氯酸消毒液，一般不會刺激皮膚。
而少部分過敏體質者皮膚比較脆弱，次氯酸消毒液接觸皮膚后，對其產生的刺激性相對較大，可能會出現皮膚泛紅、腫脹、刺痛、瘙癢、皮疹等過敏反應，所以這類人群應避免用次氯酸消毒液接觸皮膚。
需要注意的是，次氯酸自身具有不穩定性，所以在長期儲存期間，需要常溫避光的情況下儲存，且需要保證密封性。如果儲存不當，次氯酸消毒液容易產生一定量的氯氣，人體吸入后出現呼吸道刺激癥狀，如咳嗽、氣喘、呼吸困難等，嚴重者可出現化學性支氣管炎、肺炎，甚至肺水腫。應立即轉移至新鮮空氣處，并及時送醫。