一般來說，甲硝唑凝膠和壬二酸并無先后順序之分，先使用哪種藥物通常并不會影響另外一種藥物。但是對于部分皮膚敏感人群，可先使用甲硝唑凝膠。
甲硝唑凝膠是一種外用抗生素藥物，常用于治療炎癥性丘疹、酒渣鼻紅斑、膿皰瘡等。而壬二酸則是一種有機化合物，主要用于治療普通痤瘡、黑斑病等。在使用這兩種藥物同時治療疾病時，甲硝唑凝膠主要是起到殺菌，而壬二酸也是起到殺菌作用。因此，對于普通人群而言，無論哪一種藥物先使用都可以，并不會影響治療效果。對于皮膚敏感人群而言，可酌情先使用甲硝唑凝膠，后使用壬二酸，因為壬二酸具有一定刺激性，直接作用于表皮可能對敏感的肌膚造成較強刺激。
此外，這兩種藥物都可能會對皮膚造成一定刺激，因此需避免一同使用，以免促使皮膚出現發紅、發癢癥狀。若是對于這兩種藥物成分過敏的患者，則禁止使用，以免使皮損癥狀進一步加重。同時，在兩者藥物合并使用時，也一定要先詢問醫生后決定。