臨床上一般沒有“食管氣管瘺二次手術什么時候合適”的說法。通常情況下，食管氣管瘺二次手術并沒有確切的時間，當患者第一次手術后出現并發癥，或者是病情復發，均可進行食管氣管瘺二次手術。
如果患者長期存在食管氣管瘺，可以進行手術治療。術后應注意護理。若術后出現明顯的并發癥，如出現吻合口瘺、吻合口狹窄等，或者是病情復發，患者均可去醫院進行食管氣管瘺二次手術。在食管氣管瘺二次手術中，食管氣管瘺的瘺口通常會完全解剖和分離。