魚腥草是帶根全草，所以魚腥草根與魚腥草性味相同。吃魚腥草根通常具有清熱解毒、消癰排膿、利尿通淋的好處。但魚腥草性質微寒涼，若大量吃魚腥草根，可能會導致患者出現脾胃不適等壞處。
1、好處：魚腥草根寒能泄降，辛以散結，主入肺經，以清解肺熱見長，又具消癰排膿之效，因此吃魚腥草根通常具有清熱解毒、消癰排膿的好處，可以用于緩解肺癰吐膿、肺熱咳嗽、熱毒瘡毒等病癥。此外，魚腥草根還具有清熱除濕、利水通淋之效，善清膀胱濕熱，因此吃魚腥草根還具有利尿通淋的好處，可以用于緩解小便淋瀝澀痛等病癥；
2、壞處：由于魚腥草根藥性微寒涼，因此大量吃魚腥草根，可能會刺激脾胃，導致患者出現腹瀉、腹痛等不適癥狀，不利于身體健康。且對于脾胃虛寒及陰性瘡瘍者患者，需要禁吃魚腥草根，以免加重脾胃虛寒的病情，導致腹痛、腹瀉等脾胃不適癥狀進一步加重，不利于病情恢復。
此外，吃魚腥草根期間需避免食入辛辣、油膩等刺激性的飲食，如辣椒、火鍋等。以免刺激脾胃，導致脾胃功能下降，從而影響魚腥草根的藥效吸收。