一般情況下，指甲里面有肉墊可能是甲溝炎、甲癬等原因引起的，患者需要根據自身情況進行治療，具體分析如下：
1.甲溝炎：甲溝炎主要是過度修剪指甲、撕咬倒刺等因素引起的，可能會出現指甲里面有肉墊的情況，一般還伴有疼痛、發紅、腫脹等癥狀。患者可以在醫生的指導下外用紅霉素軟膏、夫西地酸乳膏等藥物進行治療，通常能夠有效控制炎癥。
2.甲癬：甲癬主要是平時不注意個人衛生、真菌感染等因素引起的，可能會出現指甲里面有肉墊的現象，一般還伴有指甲變色、甲板渾濁、指甲萎縮等癥狀。患者可以在醫生的指導下使用伊曲康唑膠囊、鹽酸特比萘芬片等藥物進行治療。