一般情況下，三個月的寶寶哭時間長了有危害，可能會導致慢性單純性咽炎、小兒支氣管肺炎等病癥，建議及時對寶寶進行安撫，如有不適癥狀及時就醫，具體分析如下：
1.慢性單純性咽炎：三個月的寶寶哭時間長了可能會對聲帶造成一定刺激，引起水腫，可能會引發慢性單純性咽炎，常伴有喉部腫痛、嘶啞等癥狀，對寶寶的健康有一定的危害。建議家長在醫生的指導下給寶寶服用銀翹散、蒲地藍消炎口服液、小兒咽扁顆粒等藥物進行治療。
2.小兒支氣管肺炎：三個月的寶寶哭時間長了可能會導致口水嗆咳，或是消耗過大導致抵抗力降低，容易受細菌、病毒的侵襲，引起小兒支氣管肺炎，常伴有咳嗽、發熱等癥狀，對寶寶健康也有一定的危害，建議家長在醫生的指導下給寶寶服用阿莫西林膠囊、阿奇霉素干混懸劑、紅霉素片等藥物進行治療。