藿香正氣水和藍芩口服液主要的區別在于藿香正氣水是溫性的，而藍芩口服液是寒涼性的。
藿香正氣水藥性比較高口感和刺激性比較強而且類不含酒精，成分有陳皮、大腹皮、半夏等具有解表化濕，理氣和中的作用，但是在臨床使用的時候更有區別，酒精過敏的人群會選擇藿香正氣水。藍芩口服液主要成分有板藍根、胖大海、黃柏等。這是一種中成藥，有瀉火解毒、止血消腫的功效，比較適用于肺胃實熱證。