藿香正氣水不能殺滅幽門螺桿菌，藿香正氣水是一種中成藥，其中的主要成分是廣藿香油、紫蘇葉油、白芷、生半夏等。藿香正氣水主要的作用是理氣和中、解表化濕，臨床上主要用于治療消化不良導致的上腹飽脹、反酸呃逆、惡心、嘔吐等癥狀。還有胃腸型感冒患者出現的上腹飽脹不適、沒有胃口，甚至有嘔吐、腹痛等，或風寒感冒患者出現的畏寒、頭暈、頭痛等癥狀。
幽門螺桿菌感染的患者需要規律使用四聯療法來進行根治治療，通常要選用兩種抗生素例如甲硝唑、克拉霉素、阿莫西林，以及質子泵抑制劑，例如奧美拉唑，以及鉍劑類藥物，如枸櫞酸鉍鉀。停藥后需復查是否完全根除幽門螺桿菌，因為長期的幽門螺桿菌感染會增加胃癌的發生率，并且會導致消化道潰瘍、消化道炎癥等多種疾病。因此，一旦發現幽門螺桿菌感染要盡早進行治療，而且幽門螺桿菌有可能通過人與人之間的唾液傳染，所以要注意防止密切接觸，治療期間與家人分餐。