羊水穿刺的針眼通常能用碘伏消毒，但是建議遵醫囑使用。
碘伏是消毒防腐劑，對多種芽孢、病毒、細菌、真菌等有殺滅作用，可以起到消毒、殺菌的效果。通常用于手術消毒，或者局部傷口消毒，可以避免微生物感染。一般在進行羊水穿刺后留下的針眼是可以遵醫囑使用碘伏消毒的，碘伏一般不會對孕婦的身體健康造成傷害，也不會影響胎兒的狀態。但是建議遵醫囑使用，否則容易導致局部過敏或損傷。
在進行羊水穿刺后，要注意局部的衛生，防止被微生物感染。