如果跑完五十米第二天腿疼，可以通過按摩、熱敷、藥物治療等方法來改善，具體分析如下：
1.按摩：如果平時不經常運動，跑完五十米后可能會使乳酸堆積在軟組織內，使肌肉產生疼痛，從而容易出現跑完五十米第二天腿疼的情況。患者可以在醫生的指導下適當進行按摩，通過按摩能夠放松肌肉，將肌肉里面的乳酸排出。
2.熱敷：跑完五十米第二天腿疼可能是肌肉勞損引起的，患者可以用熱水將毛巾打濕后適當進行熱敷，有利于加快新陳代謝，促進血液循環，有利于改善相關情況。
3.藥物治療：跑完五十米第二天腿疼時，如果患者通過按摩、熱敷的方式沒有明顯效果，應及時去醫院就診，在醫生的指導下服用尼美舒利分散片、塞來昔布膠囊、云南白藥膠囊等藥物進行治療。