惡性黑色素瘤晚期的病人，一般病情控制較差，可能發生遠處轉移。因此，病人可以伴有多種臨床癥狀，可分為惡性黑色素瘤晚期本身的癥狀，以及腫瘤發生轉移和擴散后造成的癥狀。
惡性黑色素瘤病人在晚期，多數在腫瘤局部會出現較大，與皮膚表面平齊或高出的腫物，可呈棕黃色、棕色、藍色、黑色，或者藍黑色等，以圓頂形或者息肉狀多見。病變表面可能會出現潰瘍，伴滲液、出血、刺痛或灼痛等，伴有周圍淋巴結腫大。病人可能由于腫瘤細胞擴散，出現發熱、消瘦、乏力、貧血，甚至惡液質等全身癥狀。
惡性黑色素瘤轉移到肺臟、肝臟、腦組織、骨骼等遠處器官，可以引起相應的器官功能障礙表現。比如轉移到肺，可以引起胸悶、胸痛、呼吸困難。轉移到肝臟時，可以引起食欲不振、厭油膩、惡心、嘔吐等。如果轉移到腦組織，可以引起嗜睡、頭痛、頭昏，甚至昏迷。當腫瘤轉移腦組織壓迫神經時，可以引起視物模糊不清、視力下降等。