兩個月嬰兒單邊眨眼睛，可能是眼部外傷、過敏性結膜炎、病毒性角膜炎所致，也可能倒睫等情況所致，建議及時就醫，明確具體原因，在醫生指導下對癥治療。
1、眼部外傷：如果兩個月嬰兒不小心摔倒碰到單邊眼睛，導致眼部外傷、紅腫，會使眼睛不舒服，出現兩個月嬰兒單邊眨眼睛的癥狀，可在醫生的指導下采用局部冷敷緩解癥狀，注意避免再次磕碰，癥狀會逐漸緩解；
2、過敏性結膜炎：又稱變態反應性結膜炎，如果兩個月嬰兒家中飼養寵物，兩個月嬰兒觸摸寵物后又揉搓了單邊眼睛，在過敏因素的刺激下會導致單邊眼睛發癢，出現兩個月嬰兒單邊眨眼睛的癥狀，可以在醫生的指導下使用氯雷他定糖漿等緩解過敏癥狀，同時在日常中，避免接觸動物絨毛等易過敏的物質，還要讓兩個月嬰兒避免揉眼睛；
3、病毒性角膜炎：主要是病毒感染所致，角膜上有神經分布，當受到病毒侵襲時會引起疼痛癥狀，炎癥反復刺激眼部還會有充血、流淚等癥狀。如果兩個月嬰兒患有病毒性角膜炎，眼睛疼痛會出現眨眼睛的癥狀，當單邊眼睛患病時，會有兩個月嬰兒單邊眨眼睛的情況，可在醫生的指導下使用普拉洛芬滴眼液等藥物治療；
4、倒睫：如果睫毛向后方生長觸及眼球，可導致眼睛畏光、流淚、有異物感，若單邊眼睛存在倒睫，會出現兩個月嬰兒單邊眨眼睛的癥狀，可在醫生的指導下采用物理按摩治療，可以嘗試由內眥到外眥，輕輕按壓眼瞼邊緣使眼瞼外翻，暫時緩解睫毛觸碰眼球的情況，緩解不適感，還可以采取物理拔除倒睫的方式。
兩個月嬰兒單邊眨眼睛，要注意眼部衛生，不要用不干凈的手觸碰眼睛。當發現兩個月嬰兒有異常癥狀時，建議及時就醫，避免盲目用藥，對其造成不良影響。