一般情況下，嬰兒痰中有大腸埃希菌是由飲食不衛生、近距離接觸導致傳染等方式所致，可通過改善生活習慣、使用藥物等方式來進行治療。
大腸埃希菌是寄居在人體腸道的正常菌群，嬰兒痰中有大腸埃希菌可能是家長平時給嬰兒吃的食物不衛生，從而引起腹瀉、水樣便、腹痛、嘔吐、寒顫、頭痛等癥狀，一般可以在醫生的指導下使用小兒止瀉靈顆粒、胃蛋白酶顆粒等藥物進行治療，平時注意飲食衛生，瓜果、蔬菜最好是去皮之后再服用；如果嬰兒與大腸埃希菌患者近距離接觸導致傳染，可能導致嬰兒痰中有大腸埃希菌，建議在醫生的指導下使用阿莫西林顆粒、阿奇霉素片等藥物進行治療，建議家長平時多帶嬰兒到戶外呼吸新鮮空氣、曬太陽，增強抵抗力。