電子腸鏡一般指內鏡檢查的總稱，包括普通腸鏡、無痛腸鏡、放大內鏡、超聲內鏡、色素內鏡、內鏡窄帶成像技術等，所以兩者屬于包含關系。無痛腸鏡主要從檢查過程、檢查者感受、注意事項這幾方面與其他類型的電子腸鏡有一定區別：
1、檢查過程：進行無痛腸鏡的檢查者需要使用麻醉鎮靜藥物，而其他電子腸鏡檢查一般不使用麻醉鎮靜藥物；
2、檢查者感受：部分電子腸鏡檢查者在檢查過程中，由于腸鏡要在腸道里移動牽拉腸道，會感到一定程度的腹脹、腹痛等不適癥狀，有的檢查者會因為檢查過程中身體不適對醫生的檢查產生抵抗，癥狀嚴重者甚至會拒絕醫生進一步檢查，不利于醫生的充分檢查。而進行無痛腸鏡的檢查者，一般會在無痛狀態下完成整個檢查和治療過程，無明顯痛苦感、不適感，減輕了檢查者的恐懼心理，提高了檢查者的耐受性；
3、注意事項：電子腸鏡的范圍比較廣，對于放大內鏡、超聲內鏡、色素內鏡、內鏡窄帶成像技術等新技術，診斷深度、準確性多數要大于無痛內鏡，一般不需要他人陪同，無特殊注意事項；但無痛腸鏡一般需要在家屬的陪同下完成診療，在完成檢查后，建議受檢查者休息至意識清醒再離開醫院，檢查后24小時內不得駕駛機動車輛、進行機械操作和從事高空作業。
電子腸鏡的原理是通過安裝于腸鏡前端的電子攝像探頭將結腸黏膜的圖像傳輸于電子計算機處理中心后顯示于監視器屏幕上，可觀察到大腸黏膜的微小變化，其中包括與無痛腸鏡，均是經肛門將腸鏡循管腔插至回盲部，從黏膜側觀察結腸病變的檢查方法。但無論是電子腸鏡和無痛腸鏡檢查，當天檢查者都不能進行劇烈活動，應當充分休息，避免進食生冷、辛辣、油炸等刺激胃腸道或加重胃腸道負擔的食品。