通常來說，瀉肝安神丸與清心明目上清丸的區別有成分不同、作用不同等，具體分析如下：
1.成分不同：瀉肝安神丸主要由龍膽、黃芩、梔子（姜炙）、珍珠母等中藥材組成。清心明目上清丸主要由黃連、黃芩、石膏、菊花、天花粉、薄荷、荊芥、蒺藜（去刺鹽炙）、桔梗、赤芍、當歸等中藥材組成。
2.作用不同：瀉肝安神丸具有清肝瀉火、重鎮安神等功效，主要用于肝火亢盛，心神不寧所致的失眠多夢，心煩；神經衰弱癥見上述證候者。清心明目上清丸具有清熱散風、明目止痛等功效。