IgA腎病是否嚴重，需要根據臨床分級和癥狀的嚴重程度來進行判斷。根據LEE分級，通常Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ級的IgA腎病癥狀較輕，相比較而言并不嚴重。Ⅳ、Ⅴ級的IgA腎病，腎小管和腎間質改變明顯，較為嚴重。
1、不嚴重：LEE分級中的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ級，腎小管和腎間質基本沒有改變，腎小球情況也相對較好。此時治療時對癥治療即可，如果有反復的肉眼血尿，需要控制感染，選用無腎毒性的抗生素，如肌注青霉素、口服紅霉素、口服頭孢菌素等；如果伴有蛋白尿，可選用ACEI（血管緊張素轉化酶抑制劑）或ARB（血管緊張素受體拮抗劑）治療，如卡托普利、纈沙坦等。通常經過治療，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ級患者的預后較好；
2、嚴重：LEE分級中的Ⅳ、Ⅴ級，腎小管和腎間質有明顯損傷，一般可見腎小管萎縮、間質浸潤、可見腎小球新月體等。如果伴有肌酐的升高，則病情較嚴重。此時需要使用大劑量免疫抑制劑或者其他的細胞毒藥物，如糖皮質激素、環磷酰胺等，必要時進行透析治療，這時IgA腎病就屬于比較嚴重的階段，可能出現腎病綜合征或腎衰竭等情況，預后較差。
IgA腎病可能是由于循環中的免疫復合物在腎臟內沉積，激活補體而致腎損害。IgA腎病的10年腎臟存活率為80%-85%，20年約為65%，但是個體差異較大，有些患者長期預后良好，但有些患者可能快速進展為腎衰竭。
