伸舌頭時舌根疼，可能與舌炎、上呼吸道感染、舌部潰瘍等病理性因素有關。建議患者根據實際情況選擇合適的方法來治療，具體分析如下：
1.舌炎：舌炎是指發生在舌部的炎癥，引起舌炎的因素主要有微量元素缺乏、局部刺激以及病原微生物感染等，患者常表現為舌頭腫痛、舌頭顏色改變等癥狀。患者可以服用阿莫西林膠囊、頭孢氨芐膠囊等消炎藥緩解炎癥。
2.上呼吸道感染：上呼吸道感染一般是由病原微生物感染引起的，患者常表現為發熱、咽痛、咳嗽等癥狀，也可能會出現舌根疼、腫脹等癥狀。患者在積極治療原發疾病的同時，還可以在醫生的指導下服用抗生素來緩解癥狀，如青霉素V鉀片、紅霉素腸溶片等。
3.舌部潰瘍：舌部潰瘍是由咬傷、燙傷所引起，或者是常見的復發性阿弗他潰瘍，發生于舌部，也會引起伸舌頭時舌根疼。患者可以在醫生的指導下使用口腔潰瘍含片、口腔炎噴霧劑等藥物進行治療，日常生活中適當吃清淡、富含維生素的食物，不吃辛辣刺激性食物，能有效緩解癥狀。