三歲半寶寶發燒39℃一般可以通過藥物治療或者是物理降溫的方法改善，盡快將體溫控制在正常的范圍之內，如果通過這兩種方法都不能夠達到很好的改善，并且出現了溫度持續性升高，需要及時到醫院做相關的檢查。
1、藥物治療：
三歲半寶寶發燒39℃可能是因為受到細菌或者是病毒感染引起的，一般需要配合醫生使用抗生素或者是抗病毒的藥物治療，比如阿莫西林膠囊或者是利巴韋林顆粒等，同時還需要配合退熱的藥物調理，盡快將體溫控制在正常的范圍之內，比如對乙酰氨基酚、布洛芬顆粒等，建議遵醫囑用藥。
2、物理降溫：
用藥治療期間也可以使用物理降溫的方式來控制孩子寶寶，避免體溫升高太快，導致寶寶出現高熱驚厥，昏迷，休克等情況，物理降溫主要是用溫毛巾擦拭血管比較豐富的部位，達到散熱的效果，或是使用退熱貼來達到降溫的作用。
在恢復期間還需要多給寶寶喝一些溫水，因為持續性發燒會消耗體內大量的水分，以免出現脫水或者是電解質紊亂的情況。恢復期間飲食上盡量以清淡易消化的食物為主，可以適當的喝一些粥類食物，也可以適當的吃一些蔬菜或者是水果，比如香蕉、蘋果、青菜、胡蘿卜等。