無痛腸鏡并不是真的無痛，患者醒后還是會有一定的感覺。
無痛腸鏡主要是通過靜脈注射麻藥，通常是丙泊酚，可以抑制人體的中樞神經系統，使人體進入一種麻醉狀態。當麻醉成功以后，在做腸鏡時會往腸腔內注氣，從而導致腸腔擴張、平滑肌痙攣。雖然患者處于麻醉中，不會產生痛覺，但是如果腸道擴張比較強烈，平滑肌痙攣，患者仍會有一些不自主的反應，比如抖腿、伸腿等。無痛腸鏡只是一種簡稱，做不到真正的無痛，患者醒來以后還是會有腹痛、腹脹的感覺，并且有時腹痛會比較嚴重，所以無痛腸鏡結束后需要密切觀察。如果腹痛持續不緩解，這時需要做立位腹平片或者是CT檢查，排除腸道穿孔的情況。
做完無痛腸鏡后為了減少麻藥的副作用，建議患者臥床休息6個小時以上，根據實際情況，適當的進食。