通常情況下，做無痛胃鏡是不痛的。患者會在麻醉狀態下進行胃鏡檢查，檢查過程中一般無明顯痛苦感，而且避免了普通胃鏡過程中的緊張、焦慮、惡心、嘔吐等感覺，可以增加診斷率、減少漏診率。
臨床中大多數行無痛胃鏡檢查，做胃鏡前麻醉醫師會提前擺好體位，給予吸氧、心電監護，準備工作結束后，靜脈給予給丙泊酚等短效麻醉劑，幫助患者進入鎮靜、睡眠狀態，然后專業的醫師進行胃鏡檢查。短效麻醉劑使檢查過程無痛、舒適，患者能夠在平靜的過程中配合醫生，順利完成檢查。
另外，在無痛胃鏡檢查完之后，患者蘇醒的速度也比較快，副作用較小，部分患者麻醉清醒之后，可能感覺到頭暈、乏力等情況，但在可以忍受的范圍內，不用過于擔心。平常害怕疼痛，焦慮、緊張，以及沒有嚴重心肺疾病的患者，可考慮行無痛胃鏡，有助于胃部疾病早發現、早治療、提高胃癌檢出率。
