通常情況下，睡覺時蓋的被子薄了就腿疼可能是缺鈣、膝關節炎等原因引起的，患者需要根據實際情況進行治療。具體分析如下：
1.缺鈣：鈣攝入不足容易導致缺鈣，常伴有厭食、失眠等癥狀，可能會出現睡覺時蓋的被子薄了就腿疼的情況。患者可以遵醫囑服用碳酸鈣D3片、碳酸鈣顆粒等藥物進行治療，從而起到補鈣的作用。
2.膝關節炎：外傷、膝關節退行性病變等原因容易引起膝關節炎，常伴有酸痛、膝關節腫脹等癥狀，可能會出現睡覺時蓋的被子薄了就腿疼的情況。患者可以在醫生的指導下服用布洛芬緩釋膠囊、塞來昔布膠囊等藥物進行治療，可以起到緩解疼痛的作用。
治療期間，患者要保證充足的睡眠時間，不要長期熬夜，還要做好局部保暖的護理工作，盡量不要進行劇烈運動，飲食上盡量以蛋白質含量豐富的食物為主。